All’interno della basilica di San Clemente sono conservati tutt’oggi i resti di San Clemente Papa (terzo successore di S. Pietro), di Sant’ Ignazio di Antiochia e di S. Cirillo. San Cirillo e suo fratello San Metodio sono apostoli degli slavi e fra i Patroni d’Europa. Originari di Tessalonica, nell’863 evangelizzarono la Moravia (per cui sono particolarmente cari alla comunità della Repubblica Ceca) e contribuirono allo sviluppo della letteratura slava. San Cirillo durante una precedente missione, in Crimea, trovò le reliquie di S. Clemente. Nell’867, dopo aver tradotto i testi liturgici slavi, i due fratelli giunsero a Roma per l’approvazione da parte di Papa Adriano II. Subito dopo, San Cirillo si ammalò, ma decise comunque di entrare nel monastero di monaci greci presso la basilica di Santa Prassede dove morì nell’869, all’età di 42 anni. Metodio, riuscì ad ottenere il permesso di seppellire le spoglie del Santo presso la basilica di San Clemente, in modo tale che il fratello potesse riposare accanto a papa Clemente le cui reliquie i due fratelli avevano portato a Roma. La chiesa attuale, edificata nel XII secolo, è custodita e amministrata dai Padri Domenicani Irlandesi dal 1677. Nel 1857, il priore P. Joseph Mullooly, effettuò lavori di scavo che portarono alla luce l’antica Basilica di San Clemente del IV secolo e un altro livello inferiore con edifici del I secolo.
Uvnitř baziliky sv. Klimenta jsou dodnes uchovávány ostatky papeže svatého Klimenta (třetího následovníka Petrova), svatého Ignáce z Antiochie a svatého Cyrila. Svatý Cyril a jeho bratr Metoděj jsou apoštoly Slovanů a spolupatrony Evropy. Pocházeli ze Soluně. V roce 863 přinesli křesťanskou víru na Velkou Moravu, díky čemuž jsou zvláště blízcí obyvatelům České republiky. Přispěli také k rozvoji slovanské literatury. Svatý Cyril během své předchozí misie na Krymu objevil ostatky svatého Klimenta. Svatí bratři přeložili liturgické texty do staroslověnštiny a v r. 867 se vydali do Říma, aby je nechali schválit papežem Hadriánem II. Záhy, ještě během pobytu v Římě, svatý Cyril onemocněl a rozhodl se zůstat v klášteře řeckých mnichů u baziliky svaté Praxedy, kde zemřel v roce 869 ve věku 42 let. Metoděj získal povolení pohřbít svého bratra v bazilice svatého Klimenta, tak aby svatý Cyril mohl odpočívat poblíž papeže Klimenta, jehož ostatky přinesl do Říma. Současná bazilika, vybudovaná ve 12. století, je spravována Irskými otci dominikány od r. 1677. V r. 1857 představený jejich komunity P. Joseph Mullooly provedl archeologické výzkumy, které odkryly původní baziliku svatého Klimenta ze 4. století n.l. a další podzemní podlaží se stavbami z 1. století n.l.
